早於1932年成立，原名為澳門慈幼鮑思高同學會。於1996年4月3日向政府註冊立案。同時，鑑於原會名長期與澳門鮑思高同學會互相混淆，故在註冊立案之際正式將本會名稱改為現時的名字 - 「澳門慈幼校友會」。